Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GADD45GIP1Q8TAE8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GADD45GIP1Q8TAE8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GADD45GIP1Q8TAE8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GADD45GIP1Q8TAE8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GADD45GIP1Q8TAE8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GADD45GIP1Q8TAE8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GADD45GIP1Q8TAE8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GADD45GIP1Q8TAE8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GADD45GIP1Q8TAE8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GADD45GIP1Q8TAE8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GADD45GIP1Q8TAE8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GADD45GIP1Q8TAE8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GADD45GIP1Q8TAE8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms