Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS2

GOT1L1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1L1Q8NHS2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOT1L1Q8NHS2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOT1L1Q8NHS2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOT1L1Q8NHS2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOT1L1Q8NHS2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOT1L1Q8NHS2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOT1L1Q8NHS2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOT1L1Q8NHS2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOT1L1Q8NHS2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms