Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP43Q8NFH3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP43Q8NFH3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP43Q8NFH3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP43Q8NFH3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP43Q8NFH3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP43Q8NFH3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP43Q8NFH3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP43Q8NFH3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP43Q8NFH3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP43Q8NFH3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP43Q8NFH3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP43Q8NFH3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP43Q8NFH3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP43Q8NFH3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP43Q8NFH3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP43Q8NFH3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP43Q8NFH3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms