Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF248Q8NDW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF248Q8NDW4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF248Q8NDW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF248Q8NDW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF248Q8NDW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF248Q8NDW4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF248Q8NDW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF248Q8NDW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF248Q8NDW4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF248Q8NDW4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF248Q8NDW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF248Q8NDW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF248Q8NDW4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF248Q8NDW4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF248Q8NDW4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF248Q8NDW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF248Q8NDW4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF248Q8NDW4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF248Q8NDW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF248Q8NDW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF248Q8NDW4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF248Q8NDW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF248Q8NDW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms