Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD4Q8NC06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACBD4Q8NC06 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACBD4Q8NC06 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACBD4Q8NC06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACBD4Q8NC06 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACBD4Q8NC06 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACBD4Q8NC06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACBD4Q8NC06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms