Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNTD1Q8N9Z9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNTD1Q8N9Z9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNTD1Q8N9Z9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNTD1Q8N9Z9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNTD1Q8N9Z9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNTD1Q8N9Z9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNTD1Q8N9Z9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNTD1Q8N9Z9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNTD1Q8N9Z9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNTD1Q8N9Z9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNTD1Q8N9Z9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNTD1Q8N9Z9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNTD1Q8N9Z9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNTD1Q8N9Z9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNTD1Q8N9Z9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNTD1Q8N9Z9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNTD1Q8N9Z9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNTD1Q8N9Z9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD1Q8N9Z9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMNTD1Q8N9Z9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNTD1Q8N9Z9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms