Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSGALNACT2Q8N6G5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSGALNACT2Q8N6G5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSGALNACT2Q8N6G5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CSGALNACT2Q8N6G5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CSGALNACT2Q8N6G5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSGALNACT2Q8N6G5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSGALNACT2Q8N6G5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CSGALNACT2Q8N6G5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSGALNACT2Q8N6G5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSGALNACT2Q8N6G5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSGALNACT2Q8N6G5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSGALNACT2Q8N6G5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSGALNACT2Q8N6G5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms