Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TCP11L2Q8N4U5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TCP11L2Q8N4U5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TCP11L2Q8N4U5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TCP11L2Q8N4U5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TCP11L2Q8N4U5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TCP11L2Q8N4U5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TCP11L2Q8N4U5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TCP11L2Q8N4U5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TCP11L2Q8N4U5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TCP11L2Q8N4U5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TCP11L2Q8N4U5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TCP11L2Q8N4U5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TCP11L2Q8N4U5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TCP11L2Q8N4U5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TCP11L2Q8N4U5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TCP11L2Q8N4U5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TCP11L2Q8N4U5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TCP11L2Q8N4U5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TCP11L2Q8N4U5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TCP11L2Q8N4U5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TCP11L2Q8N4U5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TCP11L2Q8N4U5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TCP11L2Q8N4U5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TCP11L2Q8N4U5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TCP11L2Q8N4U5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TCP11L2Q8N4U5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TCP11L2Q8N4U5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TCP11L2Q8N4U5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TCP11L2Q8N4U5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TCP11L2Q8N4U5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TCP11L2Q8N4U5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TCP11L2Q8N4U5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TCP11L2Q8N4U5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TCP11L2Q8N4U5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TCP11L2Q8N4U5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TCP11L2Q8N4U5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TCP11L2Q8N4U5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TCP11L2Q8N4U5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TCP11L2Q8N4U5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TCP11L2Q8N4U5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TCP11L2Q8N4U5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TCP11L2Q8N4U5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TCP11L2Q8N4U5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TCP11L2Q8N4U5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TCP11L2Q8N4U5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TCP11L2Q8N4U5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TCP11L2Q8N4U5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TCP11L2Q8N4U5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TCP11L2Q8N4U5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TCP11L2Q8N4U5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms