Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CHCHD4Q8N4Q1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHCHD4Q8N4Q1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHCHD4Q8N4Q1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHCHD4Q8N4Q1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHCHD4Q8N4Q1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHCHD4Q8N4Q1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHCHD4Q8N4Q1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHCHD4Q8N4Q1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHCHD4Q8N4Q1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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