Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RYBPQ8N488 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RYBPQ8N488 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RYBPQ8N488 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RYBPQ8N488 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RYBPQ8N488 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RYBPQ8N488 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RYBPQ8N488 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RYBPQ8N488 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RYBPQ8N488 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RYBPQ8N488 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RYBPQ8N488 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RYBPQ8N488 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RYBPQ8N488 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RYBPQ8N488 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RYBPQ8N488 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RYBPQ8N488 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RYBPQ8N488 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RYBPQ8N488 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RYBPQ8N488 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RYBPQ8N488 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RYBPQ8N488 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RYBPQ8N488 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RYBPQ8N488 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RYBPQ8N488 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RYBPQ8N488 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RYBPQ8N488 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RYBPQ8N488 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RYBPQ8N488 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RYBPQ8N488 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RYBPQ8N488 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RYBPQ8N488 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RYBPQ8N488 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RYBPQ8N488 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RYBPQ8N488 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms