Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PELI3Q8N2H9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PELI3Q8N2H9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PELI3Q8N2H9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PELI3Q8N2H9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PELI3Q8N2H9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PELI3Q8N2H9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PELI3Q8N2H9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PELI3Q8N2H9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PELI3Q8N2H9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PELI3Q8N2H9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PELI3Q8N2H9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PELI3Q8N2H9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PELI3Q8N2H9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PELI3Q8N2H9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PELI3Q8N2H9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PELI3Q8N2H9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PELI3Q8N2H9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PELI3Q8N2H9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PELI3Q8N2H9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PELI3Q8N2H9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PELI3Q8N2H9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PELI3Q8N2H9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms