Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYS1

PM20D2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PM20D2Q8IYS1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PM20D2Q8IYS1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PM20D2Q8IYS1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PM20D2Q8IYS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PM20D2Q8IYS1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PM20D2Q8IYS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PM20D2Q8IYS1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PM20D2Q8IYS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms