Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWN7

RP1L1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1L1Q8IWN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RP1L1Q8IWN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RP1L1Q8IWN7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RP1L1Q8IWN7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP1L1Q8IWN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP1L1Q8IWN7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RP1L1Q8IWN7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP1L1Q8IWN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1L1Q8IWN7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RP1L1Q8IWN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RP1L1Q8IWN7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RP1L1Q8IWN7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RP1L1Q8IWN7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms