Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3BQ8IVW6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ARID3BQ8IVW6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID3BQ8IVW6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID3BQ8IVW6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3BQ8IVW6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3BQ8IVW6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID3BQ8IVW6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID3BQ8IVW6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID3BQ8IVW6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID3BQ8IVW6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID3BQ8IVW6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID3BQ8IVW6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3BQ8IVW6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3BQ8IVW6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms