Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
WDR49Q8IV35 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
WDR49Q8IV35 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR49Q8IV35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDR49Q8IV35 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR49Q8IV35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR49Q8IV35 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR49Q8IV35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR49Q8IV35 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR49Q8IV35 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDR49Q8IV35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR49Q8IV35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR49Q8IV35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR49Q8IV35 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR49Q8IV35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR49Q8IV35 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
WDR49Q8IV35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR49Q8IV35 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR49Q8IV35 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR49Q8IV35 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR49Q8IV35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 496.9 ms