Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRLF3Q8IUI8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRLF3Q8IUI8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRLF3Q8IUI8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRLF3Q8IUI8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRLF3Q8IUI8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRLF3Q8IUI8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRLF3Q8IUI8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRLF3Q8IUI8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLF3Q8IUI8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLF3Q8IUI8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLF3Q8IUI8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRLF3Q8IUI8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRLF3Q8IUI8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRLF3Q8IUI8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRLF3Q8IUI8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRLF3Q8IUI8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms