Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHSY1Q86X52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHSY1Q86X52 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHSY1Q86X52 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHSY1Q86X52 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CHSY1Q86X52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHSY1Q86X52 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHSY1Q86X52 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHSY1Q86X52 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHSY1Q86X52 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHSY1Q86X52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHSY1Q86X52 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHSY1Q86X52 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHSY1Q86X52 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHSY1Q86X52 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHSY1Q86X52 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHSY1Q86X52 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHSY1Q86X52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHSY1Q86X52 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHSY1Q86X52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHSY1Q86X52 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHSY1Q86X52 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHSY1Q86X52 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHSY1Q86X52 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHSY1Q86X52 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHSY1Q86X52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHSY1Q86X52 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHSY1Q86X52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHSY1Q86X52 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms