Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTAR1Q7Z6K3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTAR1Q7Z6K3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTAR1Q7Z6K3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTAR1Q7Z6K3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTAR1Q7Z6K3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTAR1Q7Z6K3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTAR1Q7Z6K3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTAR1Q7Z6K3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTAR1Q7Z6K3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTAR1Q7Z6K3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTAR1Q7Z6K3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTAR1Q7Z6K3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms