Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDDC2Q7Z4H3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDDC2Q7Z4H3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDDC2Q7Z4H3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDDC2Q7Z4H3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDDC2Q7Z4H3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDDC2Q7Z4H3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDDC2Q7Z4H3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDDC2Q7Z4H3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDDC2Q7Z4H3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDDC2Q7Z4H3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDDC2Q7Z4H3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDDC2Q7Z4H3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms