Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E5

ARMC9, LisH domain-containing protein ARMC9, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC9Q7Z3E5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARMC9Q7Z3E5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARMC9Q7Z3E5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARMC9Q7Z3E5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARMC9Q7Z3E5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARMC9Q7Z3E5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ARMC9Q7Z3E5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARMC9Q7Z3E5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARMC9Q7Z3E5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARMC9Q7Z3E5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARMC9Q7Z3E5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARMC9Q7Z3E5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARMC9Q7Z3E5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARMC9Q7Z3E5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARMC9Q7Z3E5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARMC9Q7Z3E5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ARMC9Q7Z3E5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARMC9Q7Z3E5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARMC9Q7Z3E5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARMC9Q7Z3E5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARMC9Q7Z3E5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARMC9Q7Z3E5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARMC9Q7Z3E5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARMC9Q7Z3E5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARMC9Q7Z3E5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARMC9Q7Z3E5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARMC9Q7Z3E5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARMC9Q7Z3E5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARMC9Q7Z3E5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARMC9Q7Z3E5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARMC9Q7Z3E5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARMC9Q7Z3E5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARMC9Q7Z3E5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ARMC9Q7Z3E5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARMC9Q7Z3E5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
ARMC9Q7Z3E5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ARMC9Q7Z3E5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ARMC9Q7Z3E5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARMC9Q7Z3E5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARMC9Q7Z3E5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms