Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP54Q7Z3B4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP54Q7Z3B4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP54Q7Z3B4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP54Q7Z3B4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP54Q7Z3B4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP54Q7Z3B4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP54Q7Z3B4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP54Q7Z3B4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP54Q7Z3B4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP54Q7Z3B4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP54Q7Z3B4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP54Q7Z3B4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms