Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
COPS6Q7L5N1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
COPS6Q7L5N1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
COPS6Q7L5N1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
COPS6Q7L5N1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
COPS6Q7L5N1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
COPS6Q7L5N1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
COPS6Q7L5N1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COPS6Q7L5N1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
COPS6Q7L5N1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
COPS6Q7L5N1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
COPS6Q7L5N1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
COPS6Q7L5N1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
COPS6Q7L5N1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
COPS6Q7L5N1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
COPS6Q7L5N1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
COPS6Q7L5N1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COPS6Q7L5N1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
COPS6Q7L5N1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
COPS6Q7L5N1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
COPS6Q7L5N1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
COPS6Q7L5N1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
COPS6Q7L5N1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
COPS6Q7L5N1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
COPS6Q7L5N1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
COPS6Q7L5N1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
COPS6Q7L5N1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
COPS6Q7L5N1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
COPS6Q7L5N1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms