Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
H2AFVQ71UI9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H2AFVQ71UI9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H2AFVQ71UI9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
H2AFVQ71UI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
H2AFVQ71UI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
H2AFVQ71UI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
H2AFVQ71UI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
H2AFVQ71UI9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
H2AFVQ71UI9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H2AFVQ71UI9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H2AFVQ71UI9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
H2AFVQ71UI9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
H2AFVQ71UI9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
H2AFVQ71UI9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H2AFVQ71UI9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
H2AFVQ71UI9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H2AFVQ71UI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H2AFVQ71UI9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms