Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC149Q6ZUS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC149Q6ZUS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC149Q6ZUS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC149Q6ZUS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC149Q6ZUS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC149Q6ZUS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC149Q6ZUS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC149Q6ZUS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC149Q6ZUS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC149Q6ZUS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC149Q6ZUS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC149Q6ZUS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms