Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDZRN4Q6ZMN7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDZRN4Q6ZMN7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDZRN4Q6ZMN7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDZRN4Q6ZMN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDZRN4Q6ZMN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDZRN4Q6ZMN7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDZRN4Q6ZMN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDZRN4Q6ZMN7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDZRN4Q6ZMN7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDZRN4Q6ZMN7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDZRN4Q6ZMN7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms