Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE24

RBMS3, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS3Q6XE24 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RBMS3Q6XE24 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBMS3Q6XE24 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBMS3Q6XE24 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBMS3Q6XE24 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBMS3Q6XE24 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBMS3Q6XE24 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS3Q6XE24 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS3Q6XE24 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBMS3Q6XE24 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms