Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL4Q6XD76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL4Q6XD76 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ASCL4Q6XD76 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASCL4Q6XD76 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL4Q6XD76 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL4Q6XD76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASCL4Q6XD76 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL4Q6XD76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL4Q6XD76 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL4Q6XD76 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms