Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VSTM1Q6UX27 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VSTM1Q6UX27 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VSTM1Q6UX27 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VSTM1Q6UX27 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VSTM1Q6UX27 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VSTM1Q6UX27 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VSTM1Q6UX27 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VSTM1Q6UX27 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VSTM1Q6UX27 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VSTM1Q6UX27 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms