Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABRAXAS1Q6UWZ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms