Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF9

FAM180A, Protein FAM180A, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM180AQ6UWF9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM180AQ6UWF9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM180AQ6UWF9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM180AQ6UWF9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM180AQ6UWF9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM180AQ6UWF9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM180AQ6UWF9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM180AQ6UWF9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM180AQ6UWF9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM180AQ6UWF9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM180AQ6UWF9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM180AQ6UWF9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM180AQ6UWF9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM180AQ6UWF9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms