Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHBDF2Q6PJF5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RHBDF2Q6PJF5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RHBDF2Q6PJF5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RHBDF2Q6PJF5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RHBDF2Q6PJF5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RHBDF2Q6PJF5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RHBDF2Q6PJF5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RHBDF2Q6PJF5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RHBDF2Q6PJF5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RHBDF2Q6PJF5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHBDF2Q6PJF5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RHBDF2Q6PJF5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHBDF2Q6PJF5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHBDF2Q6PJF5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHBDF2Q6PJF5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RHBDF2Q6PJF5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHBDF2Q6PJF5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RHBDF2Q6PJF5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RHBDF2Q6PJF5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RHBDF2Q6PJF5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RHBDF2Q6PJF5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RHBDF2Q6PJF5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RHBDF2Q6PJF5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHBDF2Q6PJF5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RHBDF2Q6PJF5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RHBDF2Q6PJF5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHBDF2Q6PJF5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RHBDF2Q6PJF5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RHBDF2Q6PJF5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RHBDF2Q6PJF5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHBDF2Q6PJF5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHBDF2Q6PJF5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHBDF2Q6PJF5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHBDF2Q6PJF5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms