Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL35Q6PF15 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL35Q6PF15 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL35Q6PF15 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL35Q6PF15 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL35Q6PF15 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL35Q6PF15 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL35Q6PF15 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL35Q6PF15 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL35Q6PF15 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL35Q6PF15 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL35Q6PF15 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHL35Q6PF15 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL35Q6PF15 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL35Q6PF15 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms