Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRNP1Q6NT89 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRNP1Q6NT89 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRNP1Q6NT89 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRNP1Q6NT89 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRNP1Q6NT89 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRNP1Q6NT89 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRNP1Q6NT89 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRNP1Q6NT89 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRNP1Q6NT89 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRNP1Q6NT89 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRNP1Q6NT89 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRNP1Q6NT89 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRNP1Q6NT89 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRNP1Q6NT89 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRNP1Q6NT89 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRNP1Q6NT89 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms