Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFRP4Q6FHJ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFRP4Q6FHJ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFRP4Q6FHJ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP4Q6FHJ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP4Q6FHJ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFRP4Q6FHJ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP4Q6FHJ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFRP4Q6FHJ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFRP4Q6FHJ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFRP4Q6FHJ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFRP4Q6FHJ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFRP4Q6FHJ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms