Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDS2

UHRF1BP1, UHRF1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1BP1Q6BDS2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
UHRF1BP1Q6BDS2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.16
UHRF1BP1Q6BDS2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
UHRF1BP1Q6BDS2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
UHRF1BP1Q6BDS2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
UHRF1BP1Q6BDS2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
UHRF1BP1Q6BDS2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
UHRF1BP1Q6BDS2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
UHRF1BP1Q6BDS2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
UHRF1BP1Q6BDS2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
UHRF1BP1Q6BDS2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
UHRF1BP1Q6BDS2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
UHRF1BP1Q6BDS2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
UHRF1BP1Q6BDS2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
UHRF1BP1Q6BDS2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
UHRF1BP1Q6BDS2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
UHRF1BP1Q6BDS2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
UHRF1BP1Q6BDS2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
UHRF1BP1Q6BDS2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
UHRF1BP1Q6BDS2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
UHRF1BP1Q6BDS2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
UHRF1BP1Q6BDS2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.86■■■■■ 4.13
UHRF1BP1Q6BDS2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
UHRF1BP1Q6BDS2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
UHRF1BP1Q6BDS2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
UHRF1BP1Q6BDS2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
UHRF1BP1Q6BDS2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
UHRF1BP1Q6BDS2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.76■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
UHRF1BP1Q6BDS2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
UHRF1BP1Q6BDS2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
UHRF1BP1Q6BDS2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
UHRF1BP1Q6BDS2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
UHRF1BP1Q6BDS2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
UHRF1BP1Q6BDS2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
UHRF1BP1Q6BDS2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
UHRF1BP1Q6BDS2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
UHRF1BP1Q6BDS2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
UHRF1BP1Q6BDS2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
UHRF1BP1Q6BDS2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
UHRF1BP1Q6BDS2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
UHRF1BP1Q6BDS2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
UHRF1BP1Q6BDS2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.56■■■■■ 4.08
UHRF1BP1Q6BDS2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
UHRF1BP1Q6BDS2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
UHRF1BP1Q6BDS2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
UHRF1BP1Q6BDS2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
UHRF1BP1Q6BDS2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
UHRF1BP1Q6BDS2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
UHRF1BP1Q6BDS2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
UHRF1BP1Q6BDS2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
UHRF1BP1Q6BDS2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
UHRF1BP1Q6BDS2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
UHRF1BP1Q6BDS2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
UHRF1BP1Q6BDS2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
UHRF1BP1Q6BDS2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
UHRF1BP1Q6BDS2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
UHRF1BP1Q6BDS2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
UHRF1BP1Q6BDS2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
UHRF1BP1Q6BDS2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.3■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
UHRF1BP1Q6BDS2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
UHRF1BP1Q6BDS2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms