Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPECC1LQ69YQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPECC1LQ69YQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPECC1LQ69YQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPECC1LQ69YQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SPECC1LQ69YQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SPECC1LQ69YQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPECC1LQ69YQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1LQ69YQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPECC1LQ69YQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPECC1LQ69YQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPECC1LQ69YQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPECC1LQ69YQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPECC1LQ69YQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPECC1LQ69YQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPECC1LQ69YQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPECC1LQ69YQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPECC1LQ69YQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPECC1LQ69YQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1LQ69YQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1LQ69YQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms