Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM236Q5W0B7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM236Q5W0B7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM236Q5W0B7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM236Q5W0B7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM236Q5W0B7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM236Q5W0B7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM236Q5W0B7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM236Q5W0B7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM236Q5W0B7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM236Q5W0B7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM236Q5W0B7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM236Q5W0B7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM236Q5W0B7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM236Q5W0B7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM236Q5W0B7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM236Q5W0B7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM236Q5W0B7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM236Q5W0B7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM236Q5W0B7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM236Q5W0B7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM236Q5W0B7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM236Q5W0B7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM236Q5W0B7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms