Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM78BQ5VT40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM78BQ5VT40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM78BQ5VT40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM78BQ5VT40 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM78BQ5VT40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM78BQ5VT40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM78BQ5VT40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM78BQ5VT40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM78BQ5VT40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM78BQ5VT40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms