Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SAMD5Q5TGI4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SAMD5Q5TGI4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAMD5Q5TGI4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMD5Q5TGI4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMD5Q5TGI4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAMD5Q5TGI4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD5Q5TGI4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD5Q5TGI4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms