Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA31

RNF187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF187Q5TA31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF187Q5TA31 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF187Q5TA31 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF187Q5TA31 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF187Q5TA31 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF187Q5TA31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF187Q5TA31 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF187Q5TA31 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF187Q5TA31 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF187Q5TA31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF187Q5TA31 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF187Q5TA31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF187Q5TA31 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF187Q5TA31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF187Q5TA31 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF187Q5TA31 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF187Q5TA31 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF187Q5TA31 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF187Q5TA31 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF187Q5TA31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF187Q5TA31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms