Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC18Q5T9S5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC18Q5T9S5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC18Q5T9S5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CCDC18Q5T9S5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CCDC18Q5T9S5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CCDC18Q5T9S5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC18Q5T9S5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
CCDC18Q5T9S5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC18Q5T9S5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CCDC18Q5T9S5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCDC18Q5T9S5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCDC18Q5T9S5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC18Q5T9S5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CCDC18Q5T9S5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms