Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNJQ5T5M9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNJQ5T5M9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNJQ5T5M9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNJQ5T5M9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNJQ5T5M9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNJQ5T5M9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNJQ5T5M9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNJQ5T5M9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNJQ5T5M9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNJQ5T5M9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNJQ5T5M9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNJQ5T5M9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNJQ5T5M9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNJQ5T5M9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNJQ5T5M9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNJQ5T5M9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms