Protein–RNA interactions for Protein: Q5R372

RABGAP1L, Rab GTPase-activating protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1LQ5R372 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABGAP1LQ5R372 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGAP1LQ5R372 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGAP1LQ5R372 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGAP1LQ5R372 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGAP1LQ5R372 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1LQ5R372 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGAP1LQ5R372 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGAP1LQ5R372 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGAP1LQ5R372 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGAP1LQ5R372 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGAP1LQ5R372 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGAP1LQ5R372 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RABGAP1LQ5R372 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGAP1LQ5R372 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGAP1LQ5R372 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGAP1LQ5R372 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGAP1LQ5R372 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGAP1LQ5R372 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABGAP1LQ5R372 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABGAP1LQ5R372 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGAP1LQ5R372 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms