Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRB2Q5IJ48 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRB2Q5IJ48 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRB2Q5IJ48 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB2Q5IJ48 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRB2Q5IJ48 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CRB2Q5IJ48 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB2Q5IJ48 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRB2Q5IJ48 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB2Q5IJ48 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRB2Q5IJ48 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRB2Q5IJ48 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB2Q5IJ48 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB2Q5IJ48 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRB2Q5IJ48 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRB2Q5IJ48 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms