Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTBL2Q562R1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTBL2Q562R1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTBL2Q562R1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTBL2Q562R1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTBL2Q562R1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTBL2Q562R1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTBL2Q562R1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTBL2Q562R1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTBL2Q562R1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTBL2Q562R1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTBL2Q562R1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms