Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SGO2Q562F6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SGO2Q562F6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SGO2Q562F6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SGO2Q562F6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SGO2Q562F6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SGO2Q562F6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SGO2Q562F6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SGO2Q562F6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SGO2Q562F6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SGO2Q562F6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SGO2Q562F6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGO2Q562F6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGO2Q562F6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGO2Q562F6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGO2Q562F6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGO2Q562F6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGO2Q562F6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGO2Q562F6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGO2Q562F6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGO2Q562F6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SGO2Q562F6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGO2Q562F6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SGO2Q562F6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGO2Q562F6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGO2Q562F6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGO2Q562F6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGO2Q562F6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGO2Q562F6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SGO2Q562F6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGO2Q562F6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms