Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL22Q53GT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL22Q53GT1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL22Q53GT1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL22Q53GT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL22Q53GT1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL22Q53GT1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL22Q53GT1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL22Q53GT1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL22Q53GT1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL22Q53GT1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL22Q53GT1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL22Q53GT1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL22Q53GT1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL22Q53GT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL22Q53GT1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL22Q53GT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL22Q53GT1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL22Q53GT1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL22Q53GT1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL22Q53GT1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL22Q53GT1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL22Q53GT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL22Q53GT1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL22Q53GT1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL22Q53GT1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL22Q53GT1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL22Q53GT1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms