Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C4orf17Q53FE4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf17Q53FE4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf17Q53FE4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf17Q53FE4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C4orf17Q53FE4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4orf17Q53FE4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf17Q53FE4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf17Q53FE4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms