Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC58Q4VC31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC58Q4VC31 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC58Q4VC31 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC58Q4VC31 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC58Q4VC31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC58Q4VC31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC58Q4VC31 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC58Q4VC31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms