Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP221Q4G0U5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP221Q4G0U5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP221Q4G0U5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP221Q4G0U5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP221Q4G0U5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP221Q4G0U5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP221Q4G0U5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP221Q4G0U5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP221Q4G0U5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP221Q4G0U5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP221Q4G0U5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP221Q4G0U5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFAP221Q4G0U5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP221Q4G0U5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP221Q4G0U5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP221Q4G0U5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP221Q4G0U5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP221Q4G0U5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP221Q4G0U5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP221Q4G0U5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CFAP221Q4G0U5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP221Q4G0U5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP221Q4G0U5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP221Q4G0U5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP221Q4G0U5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms